معلومة

كيفية تعيين اسم الجين إلى رمزه الجيني؟

كيفية تعيين اسم الجين إلى رمزه الجيني؟



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أنا أتعلم في بيانات الجينات مؤخرًا لذا أعتذر عن الأسئلة السخيفة مقدمًا. قرأت ورقة بحثية عن سرطان على الإنسان وجدت بعض الجينات المهمة. على سبيل المثال ، أدرجت الورقة أحد الجينات في اسمها باسم

جين 1: كروموسوم 12 إطار قراءة مفتوح 52

هل لي أن أعرف كيف يمكنني العثور على رمز الجين المقابل له

C12orf52

هل يوجد جدول خرائط أو أداة يمكنني استخدامها؟

شكرا جزيلا،


لسوء الحظ ، يعد تعيين اسم البروتين والجينات أحد أكثر المشكلات المزعجة في علم الأحياء الحسابي الحديث. لا توجد طريقة مؤكدة للقيام بذلك. خاصة من أسماء الجينات اليائسة مثل تلك الموجودة في الورقة التي تستشهد بها. فيما يلي بعض الخدمات التي يمكنك تجربتها على الرغم من ذلك:

  1. عام ، بحث نصي ، مفيد إذا كان لديك وصف جيني (كما في الحالة الموضحة في سؤالك):

  2. خوادم الخرائط ، مفيدة إذا كان لديك رمز / اسم جيني / بروتين فعلي (مثل P53_HUMAN ، AF240684 ، NP_001119585 إلخ)


إذا استخدم المصدر الأصلي التسمية البشرية الرسمية ، فيمكنك البحث في موقع HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee).


فقط استخدم قاعدة بيانات الجينوم مثل Ensembl. الصق اسم الجين الخاص بك في مربع البحث واضغط على "Go". النتيجة الأولى في قائمة النتائج هي ما تبحث عنه.


HGVS بسيطة

التغييرات في تسلسل الحمض النووي والحمض النووي الريبي والبروتين ، وتسمى أيضًا المتغيرات (وأحيانًا الطفرات أو الأشكال المتعددة) ، يتم وصفها باستخدام لغة معينة. لمنع اللبس في معناها أ اساسي تم تطويره لهذه اللغة ، ما يسمى ب معيار تسمية HGVS. يتم استخدام المعيار في جميع أنحاء العالم ، لا سيما في صحة الإنسان والتشخيص السريري. ستحاول هذه الصفحة شرح المعيار ، باختصار وبعبارات بسيطة. بعد القراءة ، يجب أن تكون قادرًا على فهم أساسيات مصطلحات HGVS وأن تكون قادرًا على استخدام الإنترنت للعثور على مزيد من المعلومات حول المتغيرات المحددة. بالإضافة إلى ذلك ، أثناء البحث ، يجب أن تكون قادرًا على منع ارتكاب الأخطاء التي تؤدي إلى سوء تفسير المتغير وعواقبه المحتملة. مزيد من التفاصيل ، حول جميع الموضوعات ، متاحة في مكان آخر على صفحات تسمية HGVS.


بلاط خريطة الحرارة

يتم تحجيم المربعات أو المستطيلات الفردية في خريطة الحرارة بمجموعة من الألوان تتناسب مع قيم التعبير الجيني. تجعل النتيجة خطوة للتحقق من الصفوف والأعمدة والأنماط الهيكلية للمفاصل. إنها أداة مستخدمة على نطاق واسع من قبل الإحصائيين وعلماء المعلومات الحيوية لفهم مجموعات البيانات الكبيرة متعددة الأبعاد. يساعد المرء على انتزاع المجموعات بين الجينات والعينات التي يتم التعامل معها من خلال إنشاء الجمعيات.

تتوافق تسلسلات الجينات مع صفوف المصفوفة وتتوافق الرقائق / العينات مع الأعمدة. تمثل شاشة المصفوفة الملونة مصفوفة القيم كشبكة عدد الصفوف يساوي عدد الجينات التي يتم تحليلها ، وعدد الأعمدة يساوي عدد الرقائق. يتم تلوين مربعات الشبكة وفقًا للقيمة العددية في خلية المصفوفة المقابلة. يتم تمثيل الجينات في صفوف المصفوفة والرقائق / العينات في الأعمدة. ما تحصل عليه هو إطار في مصفوفة ألوان. سيبدو هذا كشبكة من المربعات ، ملونة حسب قيم التعبير الجيني.

ستكون قادرًا على اختيار الجينات بناءً على مستويات تعبيرها في ظل ظروف مختلفة. لا يتغير الكثير ، إما لأنهم ليسوا قيد التشغيل أو يحتاجون إلى البقاء طوال الوقت. أولئك الذين لا يتغيرون هم الأكثر أهمية. هذه تمثل نغمة التوقيع للتعبير الجيني المرتبط بحالة معينة. أدناه ، أريكم مجموعة بيانات نظرية للتعبير الجيني.

الشكل 1. خريطة حرارية تمثل الجينات في أربعة ظروف تجريبية مجمعة بناءً على قيم التعبير (أداة Heatmapgenerator5)


كيفية تعيين اسم الجين إلى رمزه الجيني؟ - مادة الاحياء

بمجرد بدء إنتاج مقالتك ، يمكنك تتبع حالة مقالتك عبر تتبع مقالتك المقبولة.

  • الاقتباس: 5.6الاقتباس:
    2020: 5.6
    يقيس CiteScore متوسط ​​الاقتباسات المتلقاة لكل مستند تمت مراجعته من قِبل النظراء تم نشره في هذا العنوان. تستند قيم CiteScore إلى عدد الاقتباسات في نطاق من أربع سنوات (على سبيل المثال 2017-20) إلى المستندات التي راجعها النظراء (المقالات والمراجعات وأوراق المؤتمرات وأوراق البيانات وفصول الكتب) المنشورة في نفس السنوات التقويمية الأربع ، مقسومة على العدد من هذه الوثائق في السنوات الأربع نفسها (على سبيل المثال 2017 - 20): بيانات المصدر Scopus ، 2021
  • عامل التأثير: 2.984عامل التأثير:
    2019: 2.984
    يقيس عامل التأثير متوسط ​​عدد الاستشهادات الواردة في عام معين من خلال الأوراق المنشورة في المجلة خلال العامين السابقين.
    تقارير الاقتباس من المجلة (Clarivate Analytics، 2020)
  • عامل التأثير لمدة 5 سنوات: 2.702عامل التأثير لمدة خمس سنوات:
    2019: 2.702
    لحساب عامل التأثير لمدة خمس سنوات ، يتم احتساب الاستشهادات في عام 2019 إلى السنوات الخمس السابقة ومقسمة على عناصر المصدر المنشورة في السنوات الخمس السابقة.
    تقارير الاقتباس من المجلة (Clarivate Analytics، 2020)
  • التأثير الطبيعي للمصدر لكل ورقة (SNIP): 0.947التأثير الطبيعي للمصدر لكل ورقة (SNIP):
    2020: 0.947
    يقيس SNIP تأثير الاقتباس السياقي من خلال ترجيح الاقتباسات بناءً على العدد الإجمالي للاقتباسات في حقل الموضوع.
  • تصنيف مجلة SCImago (SJR): 0.916تصنيف مجلة SCImago (SJR):
    2020: 0.916
    SJR هو مقياس هيبة يعتمد على فكرة أن ليست كل الاستشهادات متطابقة. تستخدم SJR خوارزمية مشابهة لترتيب صفحة Google ، فهي توفر مقياسًا كميًا ونوعيًا لتأثير المجلة.
  • عرض المزيد في Journal Insights

. معلومات مهمة لمؤلفي المعاهد الوطنية للصحة.

هذه مجلة تحويلية.

الجين تنشر أوراقًا تركز على اللائحة, التعبير, وظيفة و تطور من الجينات في جميع السياقات البيولوجية ، بما في ذلك جميع الكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة ، وكذلك الفيروسات.

الجين تسعى جاهدة لتكون مجلة متنوعة للغاية وسيتم النظر في الموضوعات في جميع المجالات للنشر. بالرغم ان.

الجين تنشر أوراقًا تركز على اللائحة, التعبير, وظيفة و تطور من الجينات في جميع السياقات البيولوجية ، بما في ذلك جميع الكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة ، وكذلك الفيروسات.

الجين تسعى جاهدة لتكون مجلة متنوعة للغاية وسيتم النظر في الموضوعات في جميع المجالات للنشر. على الرغم من عدم اقتصارها على ما يلي ، تشمل بعض الموضوعات العامة ما يلي:

  • منظمة الحمض النووي ، النسخ المتماثل & # 38 التطور - التركيز على الحمض النووي الجيني (التنظيم الكروموسومي ، الجينوم المقارن ، تكرار الحمض النووي ، إصلاح الحمض النووي ، الحمض النووي المتحرك ، الحمض النووي للميتوكوندريا ، DNA البلاستيدات الخضراء).
  • Expression & # 38 Function - التركيز على RNAs الوظيفية (microRNAs و tRNAs و rRNAs و mRNA splicing و polyadenylation البديل)
  • التنظيم - ركز على العمليات التي تتوسط في قراءة الجينات (علم التخلق ، الكروماتين ، كود هيستون ، النسخ ، الترجمة ، تدهور البروتين).

الجين أطلق سلسلة من المجلات المصاحبة التي تتكون منها عائلة الجينات والتي نرحب بك لتقديمها إلى:


بيولوجيا حجم البايت

منشور سريع لليوم العالمي للمرأة & # 8217 s: كيف نشأت رموز الجنس في علم الأحياء؟ ماذا تعني ♀ و في الواقع؟

تبدأ الإجابة في العصور القديمة ، عندما كانت الكواكب والآلهة مترادفة تقريبًا. كما ارتبطت الطقوس الدينية (على الأقل في أوروبا) بعمل المعادن. وهكذا ، ارتبط كل جسد سماوي بمعدن وإله وزوّد برمز مناسب ، وبالتالي:

1. الشمس (الذهب) 2. القمر (الفضة) 3. زحل (الرصاص) 4. المشتري (القصدير) 5. المريخ (الحديد) 6. الزئبق (الزئبق) 7. الزهرة (النحاس) بعد القطع الخشبية بواسطة فريز كريدل ، نُشر في Stearn 1962.

ولكن كيف هاجرت رموز المريخ (الحديد) والزهرة (النحاس) لوصف الجنس في علم الأحياء؟ يبدو واضحًا لنا أنه من بين جميع الرموز ، يتم تخصيص رمز إله الحرب للذكور ، وإلهة الحب للإناث (على الرغم من الصور النمطية) ، ولكن من كان أول من فعل ذلك؟

يمكن إرجاع الإجابة إلى أحد أعظم علماء الأحياء في كل العصور: كارل لينيوس. اشتهر بكونه والد التصنيف الحديث: لينيوس هو السبب في أننا نحدد الكائنات الحية بشكل فريد باستخدام أسماء الأجناس والأنواع في صيغة نحوية لاتينية ، وهو نظام يعرف باسم Linneael ذو الحدين. من عند الانسان العاقل إلى الإشريكية القولونية، كلنا مدينون بأسمائنا العلمية لينيوس.

لكن لينيوس كان أيضًا هو الشخص الذي يناسب رموز الكوكب في علم الأحياء. في ملاحظاته ، استخدم رمز الزهرة كاختزال للإناث ورمز المريخ كاختزال للذكور. كما استخدم زحل للإشارة إلى النباتات الخشبية ، والشمس للنباتات السنوية والمشتري للنباتات المعمرة. بالنسبة للجنس ، استخدم لينيوس رمز عطارد للنباتات الخنثى. ومع ذلك ، فقد تغير هذا الرمز & # 8217s على مر السنين ، على الأقل باختصار علمي ، ويستخدم الآن للإشارة إلى أنثى عذراء (على سبيل المثال في التحليل الجيني). استخدم لينيوس المريخ أيضًا ، بطريقة مربكة إلى حد ما ، للنباتات كل سنتين.

ولكن كيف نشأت هذه الرموز بالفعل؟ الفكرة المقبولة الآن هي أنها مشتقة من الرومان من الأحرف الأولى اليونانية للكواكب / الآلهة. لذلك تم اختصار Phosphoros Φωσφόρος (باليونانية: & # 8220Morning Star & # 8221 أو فيما بعد كوكب الزهرة) إلى Φκ و Thouros (المريخ) إلى θρ على مر السنين ، من قبل عمال المعادن والمنجمين والكيميائيين للرموز الحديثة.

كرونوس (زحل) زيوس (كوكب المشتري) ثوروس (المريخ) الفوسفور (الزهرة) ستيلبون (عطارد). بعد ستيرن 1962


علاجات كريسبر (خاصة)

تم تأسيس CRISPR Therapeutics منذ عام واحد فقط في أبريل 2014 من قبل Emmanuelle Charpentier ، وهو أيضًا أحد المخترعين المشاركين في تقنية CRISPR / Cas9. حصلت Emmanuelle Charpentier ، التي عملت مع Jennifer Doudna على CRISPR ، على حصتها في نفس براءة الاختراع وشاركت في تأسيس CRISPR Therapeutics في سويسرا. يتم دعم CRISPR Therapeutics من قبل Versant بجولة أولى من التمويل تبلغ 25 مليون دولار.


علاج او معاملة

تم تحديد توصيات لإدارة الأطفال المصابين بالودانة من قبل الأكاديمية الأمريكية لطب الأطفال لجنة علم الوراثة في المقال ، الإشراف الصحي للأطفال المصابين بالودانة. نوصي بمراجعة هذه المقالة مع مقدم (مقدمي) الرعاية الصحية لطفلك. تشمل هذه التوصيات: [2]

• مراقبة الطول والوزن ومحيط الرأس باستخدام منحنيات النمو المعيارية للودانة

• تدابير لتجنب السمنة ابتداء من الطفولة المبكرة.

• فحوصات عصبية دقيقة ، مع الإحالة إلى طبيب أعصاب الأطفال عند الضرورة

• التصوير بالرنين المغناطيسي أو التصوير المقطعي المحوسب لمنطقة ماغنوم الثقبة لتقييم نقص التوتر الشديد أو علامات انضغاط الحبل الشوكي

• الحصول على تاريخ مرضي لانقطاع النفس النومي المحتمل ، مع دراسات النوم حسب الضرورة

• تقييم لحدوث قصور صدري منخفض أو مرتفع في حالة وجود ضعف جذعي

• الإحالة إلى جراح عظام الأطفال إذا كان انحناء الساقين يتعارض مع المشي

• إدارة التهابات الأذن الوسطى المتكررة

• تقييم الكلام حسب عمر السنتين

• المراقبة الدقيقة للتكيف الاجتماعي

توفر مقالة GeneReview عن الودانة أيضًا معلومات عن الإدارة الطبية.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1152/#achondroplasia.Management

إرشادات الإدارة

  • غرفة تبادل المعلومات الإرشادية الوطنية (NGC) هي مصدر عام لإرشادات الممارسة السريرية القائمة على الأدلة. تم إنشاء NGC في الأصل من قبل وكالة أبحاث الرعاية الصحية والجودة (AHRQ) بالشراكة مع الجمعية الطبية الأمريكية والرابطة الأمريكية للخطط الصحية.
  • مشروع OrphanAnesthesia هو مشروع يهدف إلى إنشاء إرشادات خاضعة لاستعراض الأقران ويمكن الوصول إليها بسهولة للمرضى الذين يعانون من أمراض نادرة ولأطباء التخدير الذين يعتنون بهم. المشروع هو جهد تعاوني من الجمعية الألمانية للتخدير والعناية المركزة ، Orphanet ، الجمعية الأوروبية لتخدير الأطفال ، أطباء التخدير وخبراء الأمراض النادرة بهدف المساهمة في سلامة المرضى.

2. Ensembl بيومارت (https://www.ensembl.org/biomart)

UCSC Table Browser و Ensembl BioMart هما خدمتا ويب يمكن للمستخدمين التفاعل واسترجاع المعلومات الضرورية. ومع ذلك ، فإن العيب الرئيسي لهذه الخدمات هو أنها غير قابلة للتطوير ولا يمكن أتمتتها بشكل قوي. لذلك ، استخدم علماء المعلومات الحيوية حلول R و Python في خطوط أنابيب المعلوماتية الحيوية الخاصة بهم.

3. حزمة R Bioconductor - biomaRt

4. حل Biopython

يمكن لمبرمجي بايثون استخدام حزمة gffutil للتعليق على قوائم الجينات وإحداثيات الجينات. هنا ، يمكن إنشاء قاعدة بيانات من ملف gff3 باستخدام حزمة gffutil. ثم يمكن استخدام قاعدة البيانات هذه للوصول إلى إحداثيات الجينات والجينات. يتوفر هنا وصف لحزمة gffutil مع أمثلة.

تم تطوير حزمة Gffutil بشكل أساسي لأداء مهمة عامة - قراءة ملفات GFF التي تحتوي على مجموعة واسعة من البيانات الجينية. عندما يحتاج المستخدمون فقط إلى الوصول إلى إحداثيات الجينات (وليس قراءة ملفات GFF الكبيرة) ، فقد لا يوفر gffutil الحل الأمثل. لذلك تناولت هذه المشكلة في رسالتي "شرح إحداثيات الجينات وقوائم الجينات - طريقة الثعبان".


3.7 تصور البيانات في 2D: scatterplots

تُعد المخططات المبعثرة مفيدة لتصور مقارنات العلاج والاستجابة (كما في الشكل 3.3) ، أو الارتباطات بين المتغيرات (كما في الشكل 3.10) ، أو البيانات المقترنة (على سبيل المثال ، العلامات الحيوية للمرض في العديد من المرضى قبل وبعد العلاج). نستخدم بعدين من ورق الرسم ، أو الشاشة ، لتمثيل المتغيرين. دعونا نلقي نظرة على التعبير التفاضلي بين النوع البري وعينة FGF4-KO.

الشكل 3.25: مخطط مبعثر لقياسات تعبير 45101 لاثنين من العينات.

تشير التسميتان 59 E4.5 (PE) و 92 E4.5 (FGF4-KO) إلى أسماء الأعمدة (أسماء العينات) في إطار البيانات dfx ، الذي أنشأناه أعلاه. نظرًا لأنها تحتوي على أحرف خاصة (مسافات ، وأقواس ، وواصلة) وتبدأ بالأرقام ، فإننا نحتاج إلى إرفاقها بعلامات اقتباس مائلة لأسفل لجعلها قابلة للفهم نحويًا لـ R. يظهر الرسم في الشكل 3.25. نحصل على سحابة نقطية كثيفة يمكننا تجربتها وتفسيرها على أطراف السحابة ، لكن ليس لدينا حقًا أي فكرة بصريًا عن كيفية توزيع البيانات داخل المناطق الأكثر كثافة من الرسم البياني.

تتمثل إحدى الطرق السهلة لتحسين التخطيط الزائد في ضبط الشفافية (قيمة ألفا) للنقاط عن طريق تعديل معلمة ألفا لـ geom_point (الشكل 3.26).

الشكل 3.26: كما في الشكل 3.25 ، ولكن مع نقاط شبه شفافة لحل بعض الإفراط في التخطيط.

هذا بالفعل أفضل من الشكل 3.25 ، ولكن في المناطق الأكثر كثافة ، حتى النقاط شبه الشفافة تفرط بسرعة في تكوين كتلة سوداء عديمة الملامح ، في حين أن النقاط النائية الأكثر عزلة تصبح باهتة. البديل هو مخطط كفاف للكثافة ثنائية الأبعاد ، والتي لها فائدة إضافية تتمثل في عدم عرض جميع النقاط على قطعة الأرض ، كما في الشكل 3.27.

الشكل 3.27: كما في الشكل 3.25 ، ولكن تم تقديمه كمخطط كفاف لتقدير الكثافة ثنائية الأبعاد.

ومع ذلك ، نرى في الشكل 3.27 أن سحابة النقطة في أسفل اليمين (والتي تحتوي على عدد صغير نسبيًا من النقاط) لم تعد ممثلة. يمكننا التغلب على هذا إلى حد ما عن طريق تعديل عرض النطاق الترددي ومعلمات binning لـ geom_density2d (الشكل 3.28 ، اللوحة اليسرى).

الشكل 3.28: على اليسار: كما هو الحال في الشكل 3.27 ، ولكن مع عرض نطاق تجانس أصغر وتجميع أضيق لخطوط الكنتور. على اليمين: مع تعبئة اللون.

يمكننا ملء كل مسافة بين خطوط الكنتور بالكثافة النسبية للنقاط عن طريق استدعاء دالة stat_density2d صراحة (والتي تعتبر geom_density2d غلافًا) واستخدام الكائن الهندسي مضلع، كما في اللوحة اليمنى من الشكل 3.28.

استخدمنا الوظيفة brewer.pal من العبوة RColorBrewer لتعريف مقياس اللون ، وأضفنا استدعاءً لـ المتغيرين. تستحق كلتا هاتين المسألتين نظرة أعمق ، وسنتحدث أكثر عن أشكال الرسم في القسم 3.7.1 وحول الألوان في القسم 3.9.

تعد طرق التخطيط القائمة على الكثافة في الشكل 3.28 أكثر جاذبية وقابلية للتفسير من السحب ذات النقاط المفرطة في الشكلين 3.25 و 3.26 ، على الرغم من أننا يجب أن نكون حذرين في استخدامها لأننا نفقد الكثير من المعلومات حول النقاط الخارجية في المناطق المتفرقة في الحبكة. أحد الاحتمالات هو استخدام geom_point لإضافة مثل هذه النقاط مرة أخرى.

ولكن يمكن القول إن أفضل بديل ، والذي يتجنب قيود التنعيم ، هو الترابط السداسي (Carr et al. 1987).

الشكل 3.29: تجميع سداسي. على اليسار: المعلمات الافتراضية. يمينًا: أحجام حاوية أدق ومقياس ألوان مخصص.

3.7.1 رسم الأشكال

يعد اختيار الشكل المناسب لمخططك أمرًا مهمًا للتأكد من نقل المعلومات بشكل جيد. بشكل افتراضي ، يتم اختيار معلمة الشكل ، أي النسبة بين ارتفاع الرسم البياني وعرضه ، بواسطة ggplot2 بناءً على المساحة المتوفرة في جهاز الرسم الحالي. يتم تحديد عرض الجهاز وارتفاعه عند فتحه في R ، إما بشكل صريح بواسطتك أو من خلال المعلمات الافتراضية 47 47 انظر على سبيل المثال الصفحات اليدوية لوظائف pdf و png. . علاوة على ذلك ، تعتمد أبعاد الرسم البياني أيضًا على وجود أو عدم وجود زخارف إضافية ، مثل أشرطة مقياس اللون في الشكل 3.29.

هناك قاعدتان بسيطتان يمكنك تطبيقهما على مخططات التشتت:

إذا تم قياس المتغيرات على المحورين في نفس الوحدات ، فتأكد من استخدام نفس التعيين لمساحة البيانات إلى المساحة المادية - على سبيل المثال ، استخدم format_fixed. في مخططات التشتت أعلاه ، كلا المحورين هما اللوغاريتم إلى الأساس 2 لقياسات مستوى التعبير ، أي التغيير بوحدة واحدة له نفس المعنى على كلا المحورين (مضاعفة مستوى التعبير). حالة أخرى هي تحليل المكون الرئيسي (PCA) ، حيث يمثل المحور (x ) عادةً المكون 1 ، ومكون المحور (y ) 2. نظرًا لأن المحاور تنشأ من الدوران المتعامد لمساحة بيانات الإدخال ، فإننا تريد التأكد من تطابق موازينها. نظرًا لأن تباين البيانات (حسب التعريف) أصغر على طول المكون الثاني منه على طول المكون الأول (أو على الأكثر ، متساوٍ) ، فعادة ما يكون عرض مخططات PCA جيدة الصنع أكبر من الارتفاع.

إذا تم قياس المتغيرات على المحورين بوحدات مختلفة ، فلا يزال بإمكاننا ربطها ببعضها البعض من خلال مقارنة أبعادها. الافتراضي في العديد من إجراءات التخطيط في R ، بما في ذلك ggplot2، هو إلقاء نظرة على نطاق البيانات وتعيينها إلى منطقة الرسم المتاحة. ومع ذلك ، على وجه الخصوص عندما تتبع البيانات خطًا ما بشكل أو بآخر ، فإن النظر إلى المنحدر النموذجي للخط يمكن أن يكون مفيدًا. هذا يسمي الخدمات المصرفية (وليام س. كليفلاند ، ماكجيل ، وماكجيل 1988).

لتوضيح الأعمال المصرفية ، دعنا نستخدم بيانات البقع الشمسية الكلاسيكية من ورقة كليفلاند.

الشكل 3.30: بيانات البقع الشمسية. في اللوحة العلوية ، يكون شكل الرسم تربيعيًا تقريبًا ، وهو اختيار افتراضي متكرر. في اللوحة السفلية ، هناك تقنية تسمى الخدمات المصرفية تم استخدامه لاختيار شكل قطعة الأرض. (ملاحظة: وضع علامات التجزئة ليس جيدًا في هذه المؤامرة وسيستفيد من التخصيص.)

تظهر المؤامرة الناتجة في اللوحة العلوية للشكل 3.30. يمكننا أن نرى بوضوح تقلبات طويلة المدى في اتساع دورات نشاط البقع الشمسية ، مع أنشطة قصوى منخفضة بشكل خاص في أوائل القرن الثامن عشر ، وأوائل القرن التاسع عشر ، وقرب نهاية العشرين (^ text) مئة عام. ولكن الآن لنجرب الخدمات المصرفية.

كيف تعمل الخوارزمية؟ يهدف إلى جعل المنحدرات في المنحنى حول واحد. على وجه الخصوص ، يحسب bank_slopes متوسط ​​الانحدار المطلق ، ثم بالاستدعاء لـ format_fixed ، قمنا بتعيين نسبة العرض إلى الارتفاع للمخطط بحيث تصبح هذه الكمية 1. تظهر النتيجة في اللوحة السفلية من الشكل 3.30. على عكس الحدس تمامًا ، على الرغم من أن الحبكة تأخذ مساحة أصغر بكثير ، إلا أننا نرى المزيد عنها! على وجه الخصوص ، يمكننا أن نرى شكل سن المنشار لدورات البقع الشمسية ، مع ارتفاعات حادة وانخفاضات بطيئة أكثر.


تطبيقات التنبيغ البكتيري

تعتبر عملية نقل البكتيريا ضرورية للغاية ليس فقط للبكتيريا والفيروسات ولكن للكائنات الحية بشكل عام. فيما يلي الأسباب.

1. رسم خرائط الجينات البكتيرية

تعتمد كمية الحمض النووي المعبأة داخل رأس الفيروس إلى حد كبير على حجم الرأس نفسه. يتم قطع الكروموسوم المضيف بشكل عشوائي ، مع وجود نفس الاحتمالية لتعبئة جميع الجينات ونقلها إلى الناقل.

  • ومن ثم ، كلما اقتربت الجينات من بعضها البعض ، زادت فرصة تجميعها في نفس جزء الحمض النووي.
  • وبالتالي ، يمكن تعيين الجينات البكتيرية عن طريق حساب ترددات نقلها.

2. يساهم في زيادة التنوع الجيني

تزيد عملية التنبيغ البكتيري بشكل عام من التنوع الجيني. هذا مهم للغاية لأنه يسمح للكائنات الحية بالتكيف مع أي تغييرات في بيئتها.

  • إعادة التركيب الجيني هي أيضًا واحدة من النوى الأساسية لعملية تطور.

3. بمثابة مفتاح لمقاومة المضادات الحيوية

في الوقت الحاضر ، أصبحت ظاهرة مقاومة المضادات الحيوية منتشرة على نطاق واسع. يعتبر التنبيغ مهمًا بشكل خاص لأنه يمكن أن يفسر الآلية التي تصبح بها المضادات الحيوية غير فعالة بسبب انتقال الجينات بين البكتيريا.

من المؤكد أنك سمعت عن الأغاني أو مقاطع الفيديو التي تنتشر بسرعة. من أين أتت هذه الاستعارة برأيك؟


شاهد الفيديو: Alleles and Genes (أغسطس 2022).